Ich habe den Vorgänger PRS-T2 und bin auch unzufrieden mit dem Export von markierten Textstellen.
Es geht zwar mittels der Software Noteworks, aber leider auf 200 Zeichen beschränkt (bei DRM-freien Epups).
Vermutlich läßt sich diese Beschränkung nur mittels Root des Readers umgehen.
Die EReader von PocketBook sollten ideal geeignet sein (Quellcode ist auch frei verfügbar).
Hier ein Ausschnitt aus einem Test
http://allesebook.de/testbericht/test-pocketbook-touch-lux-2-43230/2/
Erstellte Notizen können über den Dateiexplorer am PC kopiert und exportiert werden. Diese befinden sich etwas versteckt im Ordner „system\config\Active Contents“ und liegen im HTML-Format vor, wobei Screenshots direkt darin platziert werden. Lediglich handschriftliche Notizen und Markierungen muss man per Hand zusammenführen, denn hier werden eine SVG-Datei und ein PNG-Screenshot der Buchseite getrennt voneinander gespeichert und nicht in der HTML-Übersicht platziert. Die Dateien besitzen jedoch den gleichen Dateinamen, sodass man sie einander einfach zuordnen kann. Die Anmerkungen in der HTML-Datei werden inkl. Positionsangabe im Quelltext in Tabellenform gespeichert, sodass es bei Bedarf möglich ist, diese weiterzuverarbeiten.
Mittlerweile ist das Modell LUX 3 verfügbar, bei dem man wie beim 2er Modell ebenfalls die Notizen einfach über einen beliebigen Dateiexplorer per USB exportieren kann
http://allesebook.de/ebook-reader/pocketbook/pocketbook-touch-lux-3/
Wenn mein Sony Gerät mal kaputt geht, werde ich auch auf ein möglichst offenes System umsteigen.
Falls Du dir schon ein anderes Gerät gekauft hast, kannst Du mir sagen, ob die Notizen und Markierungen dort besser funktionieren.