1. Ist das sicherheitstechnisch problematisch oder ist das nur ein Anzeigefehler bei PCMANFM und es kann nichts mehr passieren? Also ist das alles in Wirklichkeit ausgehängt und es reicht ein "sudo umount /media/usb-crypt?
Ein einfaches Auswerfen im Dateimanager oder ein umount sollten ausreichen, um alle Daten sicher auf den Datenträger zu schreiben.
2. Stimmt das, dass es "luks-NUMMER1" unter /dev/mapper heißt oder müsste das EIGENTLICH auch /dev/mapper/usb-crypt heißen? In /media/, wie bereits geschrieben, funktioniert es nun.
Siehe meine Antwort von oben.
3. Es scheint also, dass PCManFM Probleme mit LUKS hat. Ist das einen Bug-Report wert?
Wenn du das als Bug empfindest ...