Hi,
ich habe ein Problem beim Kompilieren der netcdf-bib (parallele Version).
Speziell hängts wohl an meinen Pfaden. Das Problem ist, ich bin kein Admin. Der Admin des Rechners hat in seinem eigenen Verzeichnis (hier: /root/treiber) eine veraltete Version installiert (auch selbst kompiliert nicht aus den repositories).
Dummerweise brauche ich eine neue Version und will diese lokal in /home/stephcar/bin installieren.
Eigentlich dachte ich, dass ich über die compiler-flags alle zu nutzenden Pfade vorschreibe:
1 | CPPFLAGS=-I/home/stephcar/bin/include LDFLAGS=-L/home/stephcar/bin/lib LIBS='-L/home/stephcar/bin/lib -lnetcdf -L/home/stephcar/bin/lib -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lm -L/home/stephcar/bin/lib -lsz' CC=/home/stephcar/bin/bin/mpicc FC=/home/stephcar/bin/bin/mpif90 ./configure --enable-pnetcdf --prefix=/home/stephcar/bin/ |
BTW: in $PATH und $LD_LIBRARY_PATH steht auch jeweils /home/stephcar/bin/ an erster Stelle, sollte also auch als erstes untersucht werden.
Dennoch funktioniert das alles nicht und das Verzichnis /root/treiber meines admins wird durchsucht ... Hier bekomme ich bei make folgenden Fehler:
/bin/sh ../libtool --tag=CC --mode=link /home/stephcar/bin/bin/mpicc -g -O2 -L/home/stephcar/bin/lib -o liboc.la liboc_la-oc.lo liboc_la-daplex.lo liboc_la-dapparse.lo liboc_la-daptab.lo liboc_la-occlientparams.lo liboc_la-occompile.lo liboc_la-occurlfunctions.lo liboc_la-ocdata.lo liboc_la-ocdebug.lo liboc_la-ocdump.lo liboc_la-ocinternal.lo liboc_la-ocnode.lo liboc_la-ochttp.lo liboc_la-ocrc.lo liboc_la-ocread.lo liboc_la-ocutil.lo liboc_la-ocbytes.lo liboc_la-oclist.lo liboc_la-ocuri.lo liboc_la-oclog.lo liboc_la-xxdr.lo -lpnetcdf -lm -L/home/stephcar/bin/lib -lnetcdf -L/home/stephcar/bin/lib -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lm -L/home/stephcar/bin/lib -lsz /usr/bin/grep: /root/treiber/hdf5-1.8.8/hdf5/lib/libhdf5_hl.la: Permission denied /usr/bin/sed: can't read /root/treiber/hdf5-1.8.8/hdf5/lib/libhdf5_hl.la: Permission denied libtool: link: `/root/treiber/hdf5-1.8.8/hdf5/lib/libhdf5_hl.la' is not a valid libtool archive make[2]: *** [liboc.la] Fehler 1
Hat da jemand eine Idee? Welche Standardpfade gibt es noch und wie kann ich diese nach einem Pattern (hier also /root/treiber) durchsuchen?
Danke Stephan
PS: Ein Installieren aus den Repositories ist auch erstmal nicht möglich...