Hi,
Thunderbird versucht automatisch, IMAP-Verbindungen aufzubauen. POP nutzt der eingebaute Konten-Assistent nicht mehr per Default. Die Meldung auf dem ersten Screenshot lässt mich auch die Verwendung von IMAP in deinem Thunderbird-Konto vermuten. Daher kam auch meine Frage, ob du schon IMAP unter Evolution verwendet hast. In diesem Fall hättest du dir nämlich die Import-Aktionen ersparen können. (IMHO ist IMAP auch die bessere Variante, da du dich so eben nicht mehr um deinen E-Mail-Bestand kümmern musst und es dem Server überlassen kannst.).
Versuch nun mal, in den lokalen Account von Thunderbird (Posteingang) zu wechseln. Wenn du darin stehst, starte noch mal den Import. Das Addon importiert deine Mails in (Unter-) Ordner. Es kann sein, dass es da zu Problemen mit deinem Account kommen kann.