ich hatte damit auch probleme, ich habe dann den kernel nich wie auf:
https://wiki.ubuntuusers.de/Kernel/Kompilierung/
mit make-kpkg --initrd buildpackage
gebaut, sondern mit
"make -j 8 deb-pkg LOCALVERSION=-MEINE_KERNELNAMENERWEITERUNG"
, wobei MEINE_KERNELNAMENERWEITERUNG ein tag ist das man dann als namen an den aktuell gebauten kernel dranhängt und das im boot menü verfügbar ist - man baut einen komplett anderen kernel.
dann installiert man einfach die entsprechenden pakete - fertig. =)
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