Hallo Peter,
evtl. stößt Du auf ein Problem mit dem Dateisystem.
Frage: Liegen direkt im Hauptverzeichnis des Sticks relativ viele Dateien mit langen Dateinamen? Das führt bei FAT32 unter Umständen zu Problemen. Probier mal das:
Lege ein paar Verzeichnisse an, also "Ordner 1", "Odner 2", usw. und kopiere alles da rein. Vielleicht ist dann das Problem schon gelöst.
Wenn das nicht klappt, formatier doch den Stick mal neu und probiere es dann mit den Unterverzeichnissen.